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单细胞转录组测序（Single cell RNA sequencing，scRNA-seq）是在单细胞水平进行高通量基因表达谱检测 ，通过对大量的单细胞基因表达数据进行细胞表达特征聚类、亚群表达特征分析、标志物筛选等，能够对复杂细胞群深入分析，避免单个细胞的异质性生物学信息被大量喜欢的均质化覆盖，在生殖、免疫 、干细胞分化、肿瘤异质性、神经系统发育及脑发育等研究领域中有着广泛的应用。
分析路线
分析内容展示
案例解析
研究背景
单细胞基因表达研究报道，到目前为止，植物的文章发表有限，尽管人们已经认识到植物中大规模单细胞转录组研究的潜在益处，本文基于10X Genomics chromium平台，分析了拟南芥根部约10,000个细胞（原生质体）的转录组数。
研究结论
基于10X Genomics chromium 平台，分析了拟南芥根部约10,000个细胞（原生质体）的转录组数据 ，从中发现了主要的组织类型以及发育不同阶段的细胞，此外还鉴定出较为稀有的细胞亚群；在此基础上，该研究重点分析了根部表皮细胞 ，基于拟时分析展示了分生组织发育过程中 hair 细胞与 non-hair细胞的分化轨迹。
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